房产公司无权扣押业主房产证。购房人以银行贷款交清房款后，就只和银行存在借贷关系。购房人已按合同履行完相应的义务，这时房产公司无权扣押业主房产证，所以依法办理的房产证和土地证应该交由业主持有。

法律依据

《中华人民共和国民法典》第五百九十五条 【买卖合同定义】买卖合同是出卖人转移标的物的所有权于买受人，买受人支付价款的合同。

《中华人民共和国民法典》第五百九十六条 【买卖合同条款】买卖合同的内容一般包括标的物的名称、数量、质量、价款、履行期限、履行地点和方式、包装方式、检验标准和方法、结算方式、合同使用的文字及其效力等条款。