旷工一天扣三天工资合法，因为根据《劳动合同法》，规定了用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资，旷工一天应当指扣除当天的工资，扣三天不合法。用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

法律依据

《中华人民共和国劳动合同法（2012修订）》第三十条 【劳动报酬】用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。