1. 税务机关对个人独资企业个人所得税的征收方法有2种，一种是查账征收适用于会计核算比较齐全的，另外一种就是核定征收啦！具体采用哪种征收方法由当地的税务主管机关确定；2. 采用查账征收方式的，以每一纳税年度的总收入，减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额，然后根据个人所得税确定的税率表对应的税率计算应纳税款；

应纳税所得额=收入总额-准予扣除项目金额，应交企业所得税=应纳税所得额 × 适用税率；

个人独资企业采取核定征收的，不用缴纳企业所得税和股东分红，只需缴纳经营所得的个人所得税；个人独资企业应视其经营、发生的业务可能征收增值税、城市维护建设税和教育费附加税；只要企业有利润，不论采用哪种征收方法，也不论企业利润是否分配，都需要缴纳个人所得税。比照个人所得税法的“个体工商户的生产经营所得”应税项目，适用5％—35％的五级超额累进税率，计算征收个人所得税。