公司收购中对小股东利益的保护方式有: 1、行使查阅、复制权,查阅、复制财务会计报告、董事会会议决议等; 2、公司收购中转让主要财产,小股东对股东会该项决议投反对票的,可以请求公司按照合理的价格收购其股权。