公司发工资扣了税没交怎么办?

发工资没扣税需要补缴税款。无论单位以何种方式支付员工工资，都是需要代收员工个人所得税以及社保和住房公积金个人缴纳部分的。所以就算使用个人账户发放员工工资，依然是需要扣除的。如果单位没有给员工报税，或者在公司的工资报备上作假，偷税漏税才属于违法。法律规定，工资、薪金所得，以每月收入额减除费用三千五百元后的余额，为应纳税所得额。