事业单位内部劳动合同制和编制的区别主要体现在以下几个方面: 1.工资开支来源不同:正式编制人员工资由财政拨款解决,合同制人员工资由单位预算外收入中解决。 2.福利待遇不同:正式编制人员的福利待遇按政策规定及上级部门规定执行,合同制人员参照正式编人员标准执行,但实际上低很多或缺项。 3.正式编人员不犯重大错误,不会被辞退,工作稳定,合同制人员随时有被裁员的风险。 4.正式编制人员可以提任副科级职务,合同制人员不可以。