现阶段，公司支付给员工的一次性年终奖，可以按年终奖收入单独申报，也可以计入工资进行申报，如果企业在实际申报过程中，发现申报错误的，可以向税务局申请修改或者重新申报，涉及到少交税额的，需要补缴个税。
个人所得税的申报方式
(1)本人直接申报纳税。
(2)委托他人申报纳税。
(3)邮寄申报。对采取邮寄申报纳税的,以寄出地的邮戳为实际申报日期。
全年一次性奖金一年可以申报几次？
全年一次性奖金报表针对同一个纳税人一个纳税年度内只允许申报一次，但并没有限制用户必须在哪一个月份申报，而是根据实际取得所得月份来判断申报时间；如果企业需要在一年发二次全年奖，请告知相同的一年不能申报2次，需要企业自己调节发放情况。
综上所述，公司支付给员工的一次性年终奖，可以按年终奖收入单独申报，也可以计入工资进行申报。希望以上回答对您有所帮助。