【法律意见】
该工时制度不涉及违法的问题，根据双方约定可采取综合工时或其他工时制度，但是超出规定工时的工作时间按照加班，由单位向员工支付加班工资。
【法律依据】
根据《劳动法》第三十六条　国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。　
第三十八条　用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。
第三十九条　企业因生产特点不能实行本法第三十六条、第三十八条规定的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法。