员工已实际工作但是没有办理入职的情况，可以与公司协商要工资，如果协商不成可以通过法律途径解决。
[法律依据]
《中华人民共和国》第十一条规定，用人单位未在用工的同时订立书面劳动合同，与劳动者约定的劳动报酬不明确的，新招用的劳动者的劳动报酬按照集体合同规定的标准执行;没有集体合同或者集体合同未规定的，实行同工同酬。