不用缴纳土地增值税。小产权房，是占用农村集体土地进行开发的商品房，国家房管部门不发给房屋所有权证，房屋的产权不受法律保护。房地产开发企业出售的小产权房不符合《土地增值税暂行条例》第二条的规定，所以不用缴纳土地增值税。
《中华人民共和国土地增值税暂行条例》(国务院令第138号，以下简称《土地增值税暂行条例》)第二条规定：转让国有土地使用权、地上的建筑物及其附着物(以下简称转让房地产)并取得收入的单位和个人，为土地增值税的纳税义务人(以下简称纳税人)，应当依照本条例缴纳土地增值税。