购买房屋进行网签后，房屋被抵押的，抵押合同是否有效要依据具体的情况才能确定，如果买房人已经支付大部分购买款的，房屋抵押合同是无效的。
《中华人民共和国物权法》第一百八十四条规定，下列财产不得抵押：
(一)土地所有权;
(二)耕地、宅基地、自留地、自留山等集体所有的土地使用权，但法律规定可以抵押的除外;
(三)学校、幼儿园、医院等以公益为目的的事业单位、社会团体的教育设施、医疗卫生设施和其他社会公益设施;
(四)所有权、使用权不明或者有争议的财产;
(五)依法被查封、扣押、监管的财产;
(六)法律、行政法规规定不得抵押的其他财产。