购房合同备案在先的。商品房契税需要在备案日期后90日内交纳。

【法律依据】

根据《中华人民共和国税收征收管理法》第三十二条规定：

纳税人未按照规定期限缴纳税款的，扣缴义务人未按照规定期限解缴税款的，税务机关除责令限期缴纳外，从滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。