驾驶证违章被扣分了罚款也交完了，查询还显示违法未处理的原因可能有：

1、查询系统存在延迟，缴纳罚款的信息不能及时同同步，可以过段时间再查询；

2、用户可能网络不稳定，新的消息没有及时刷新，建议网络好的时候刷新系统；

3、工作人员对于处理结果还没有录入，因此还没有更新；

4、可以拨打电话询问原因，或者直接到交警大队查询相关内容。