房屋拆迁补偿纠纷有下列方式处理：

一、行政裁决；根据国务院令发布的《城市房屋拆迁管理条例》规定，拆迁人与被拆迁人、被拆迁人与房屋承租人达不成拆迁补偿安置协议的，经当事人申请，由房屋拆迁管理部门裁决。

二、行政或司法强制；

三、民事仲裁或民事诉讼。