承包土地使用证的办理流程如下：

1、使用者携带相关证件到国土资源局提出申请；

2、提交相关材料；

3、国土资源局进行审核；

4、审核通过的，进行登记发证。

【法律依据】

《土地承包法》第三条规定，国家实行农村土地承包经营制度。

农村土地承包采取农村集体经济组织内部的家庭承包方式，不宜采取家庭承包方式的荒山、荒沟、荒丘、荒滩等农村土地，可以采取招标、拍卖、公开协商等方式承包。

第四条规定，国家依法保护农村土地承包关系的长期稳定。

农村土地承包后，土地的所有权性质不变。承包地不得买卖。