深圳医疗事故责任认定机构收费标准如下：

(1) 省级每例4000元，地市级每例3000元。

(2) 取消县级鉴定收费标准。

(3) 按照国家规定，经鉴定属于医疗事故的，鉴定费由医疗单位支付;不属于医疗事故的，鉴定费由提出鉴定的一方负担。

【法律依据】

《医疗事故处理条例》第二十条，卫生行政部门接到医疗机构关于重大医疗过失行为的报告或者医疗事故争议当事人要求处理医疗事故争议的申请后，对需要进行医疗事故技术鉴定的，应当交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定；医患双方协商解决医疗事故争议，需要进行医疗事故技术鉴定的，由双方当事人共同委托负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。