主体不同，提请批捕的主体是公安机关，审查起诉的主体是由人民检察院公诉科。

在案件中所处的阶段不同。审查批捕是侦查机关(一般为公安机关)在立案侦查后，对案件的基本事实有了一定的了解；

认为犯罪嫌疑人符合逮捕的条件与有逮捕的必要的，就会把案件移送到检察院侦监科申请逮捕犯罪嫌疑人；

审查起诉是侦查机关对案件侦查终结后移送到检察院提请公诉，检察院就对这些案卷进行审查。

后果不同。案件经检察院侦监科审查批捕后，后果是批准逮捕犯罪嫌疑人或者不予批准逮捕犯罪嫌疑人，案卷会移送回侦查机关继续侦查；

案件经过检察院公诉科审查终结后，后果是起诉或者不起诉，如果是符合起诉条件的案件，经过审查终结后，就会被移送到人民法院提起公诉。

【法律依据】《刑事诉讼法》第九十条：人民检察院对于公安机关提请批准逮捕的案件进行审查后，应当根据情况分别作出批准逮捕或者不批准逮捕的决定。