处理方式如下：

1.如应立案调查却适用简易程序当场处罚；应立案调查却未立案，但当事人却缴纳了罚款；对应立案调查的违法行为不进行调查。

2.依法不应当立案却立案的。如明知当事人不存在违法行为却立案调查；有证据证明违法行为涉嫌构成犯罪，应当依法移送司法机关追究刑事责任却未移送，仍立案调查。

3.立案期间错误。如立案日期早于案件来源日期；投诉、申诉、举报、其他机关移送和上级机关交办案件的立案期限超过15个工作日。

【法律依据】

《行政处罚法》第54条，行政机关应当建立健全对行政处罚的监督制度。县级以上人民政府应当加强对行政处罚的监督检查。公民、法人或者其他组织对行政机关作出的行政处罚，有权申诉或者检举；行政机关应当认真审查，发现行政处罚有错误的，应当主动改正。