农村合作医疗缴费，一般是到乡镇的民政部门去办理缴费的。不能异地办理医疗保险。只能回户籍地办理。

【法律依据】

《农村合作医疗章程》第六条，

合作医疗基金由参加合作医疗的个人和集体（公益金）筹集， 各筹多少应根据需要和可能，经社员群众讨论决定。随着集体经济的不断发展逐步扩大集体负担部分。个人和集体可以用采、种的药材折价交付合作医疗基金。