质量保修金与质量保证金最大的区别在于它们的来源不同。保修金是双方在合同中约定，在工程竣工时从应付的工程款中预留的用于保证工程维修的资金，它来源于建设单位的工程款。

而保证金是在建设工程施工合同订立之前，由施工方预先付给建设单位的用于保证施工质量的资金；

它来源于施工单位，建设单位向施工单位预收了这样质量保证金后，作为工程量的一部分再支付给施工单位，因而是一种变相的垫资施工行为。

【法律依据】《建设工程质量保证金管理暂行办法》第六条规定，在工程项目竣工前，已经缴纳履约保证金的，发包人不得同时预留工程质量保证金。

采用工程质量保证担保、工程质量保险等其他保证方式的，发包人不得再预留保证金。