企业保护商业秘密的措施：

1、建立健全企业内部保密制度首先在宣传、组织、监督、查处等方面做到有章可循、责任到人；

2、通过行政机关进行保护对侵犯他人商业秘密的行为，被侵害人可以向侵害人所在地或侵害行为发生地的县级以上工商行政管理机关申请行政保护。

【法律依据】

《反不正当竞争法》第三条，

各级人民政府应当采取措施，制止不正当竞争行为，为公平竞争创造良好的环境和条件。国务院建立反不正当竞争工作协调机制，研究决定反不正当竞争重大政策，协调处理维护市场竞争秩序的重大问题。