保密协议争议的解决方法如下：

1、协商解决；

2、协商不成的，可以申请调解；

3、不愿调解或者调解不成的，可以向劳动仲裁委员会申请仲裁；

4、对仲裁结果不服的，可以向人民法院提起诉讼。

【法律依据】

《劳动争议调解仲裁法》第五条规定，发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。