突发事件发生后依有权法对传染病疫区实行封锁的是突发事件应急处理指挥部。

【法律依据】《突发公共卫生事件应急条例》第23条规定，突发事件应急处理指挥部有权在必要时对人员进行疏散或者隔离，并可以依法对传染病疫区实行封锁。

根据突发事件应对法第49条第2项的规定，自然灾害、事故灾难或者公共卫生事件发生后；

履行统一领导职责的人民政府应当迅速控制危险源，标明危险区域，封锁危险场所，划定警戒区，实行交通管制以及其他控制措施。