个人所得税专项扣除计算方法：
1、比较简单的个人所得税计算公式是“应缴个税金额=应纳税所得额*税率-速算扣除数”，所以说，我们要计算出应纳税所得额、税率和速算扣除数这三个数。
2、应纳税所得额的意思是应该缴纳税款的部分，工资在减去5000元免征额、五险一金等项目后，剩下的部分才是应纳税所得额。
3、按照最新的税法，需要扣除的项目有5000元的免征额、三险一金等专项扣除项目、子女教育等附加的专项扣除项目以及企业年金等其它国家规定可以扣除的项目。
4、目前我国施行的是分级税率，所有人的收入都被分为了7级，每一级的税率都不一样，分别是3%、10%、20%、25%、30%、35%、45%，可以说工资越多，需要缴纳的税款也就越多。
5、速算扣除数是为了方便我们计算个税而衍生出的一个名词，因为现在是分级税率，理论上应该一级一级的计算个税，有了速算扣除数后，可以直接计算最高一级的税款，再减去速算扣除数就可以了。
6、假如说你的月工资是20000元，扣除各项税前扣除(包括5000元免征额)的费用后还剩下10000元，然后你这个月应该缴纳的个税就是10000*10%-210=790元。

法律依据

《个税专项附加扣除》第八条 　纳税人在中国境内接受学历（学位）继续教育的支出，在学历（学位）教育期间按照每月400元定额扣除。同一学历（学位）继续教育的扣除期限不能超过48个月。纳税人接受技能人员职业资格继续教育、专业技术人员职业资格继续教育的支出，在取得相关证书的当年，按照3600元定额扣除。第十一条　在一个纳税年度内，纳税人发生的与基本医保相关的医药费用支出，扣除医保报销后个人负担（指医保目录范围内的自付部分）累计超过15000元的部分，由纳税人在办理年度汇算清缴时，在80000元限额内据实扣除。第十四条　纳税人本人或者配偶单独或者共同使用商业银行或者住房公积金个人住房贷款为本人或者其配偶购买中国境内住房，发生的首套住房贷款利息支出，在实际发生贷款利息的年度，按照每月1000元的标准定额扣除，扣除期限最长不超过240个月。纳税人只能享受一次首套住房贷款的利息扣除。