一般来说，公诉案件中被告人有罪的举证责任由人民检察院承担。在公诉刑事案件中，举证责任分配的一般规则是由公诉方承担举证责任，被告人不承担举证责任。在审判中，公诉方要向法庭提供充分的证据证明其指控的犯罪事实，而且其证明要达到法定的标准。而在自诉案件中被告人有罪的举证责任由自诉人承担，这是“谁主张，谁举证”原则的体现。

法律依据

《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十一条 公诉案件中被告人有罪的举证责任由人民检察院承担，自诉案件中被告人有罪的举证责任由自诉人承担。