房屋产权人以不动产登记事务中心登记的权利人为准，如果双方约定了房屋产权的归属，仅在公证处办理公证的话，未在不动产登记事务中心登记的，双方的约定是有效的，但是协议有效不等于就产生了物权变动的效力，如果未进行产权变更登记，房屋被第三人主张权利时，公证的房屋产权约定不能产生对抗第三人的效力，房屋权利人仍以不动产登记事务中心登记的对外公示的权利人为准。

法律依据

《中华人民共和国民法典》第二百一十六条 【不动产登记簿的效力和管理】不动产登记簿是物权归属和内容的根据。
不动产登记簿由登记机构管理。

《中华人民共和国民法典》第二百一十七条 【不动产登记簿与不动产权属证书的关系】不动产权属证书是权利人享有该不动产物权的证明。不动产权属证书记载的事项，应当与不动产登记簿一致;记载不一致的，除有证据证明不动产登记簿确有错误外，以不动产登记簿为准。