事业单位员工是否适用劳动合同法，要看具体情况，像具有管理公共事务的职能组织，其员工是事业编制，不适用《劳动合同法》。而实现企业化管理的事业单位，和劳动者签署的是劳动合同，这类单位的员工同用人单位发生劳动合同争议的时候，是可以依据《劳动合同法》处理的。
《劳动合同法》第2条：中华人民共和国境内的企业、个体经济组织、民办非企业单位等组织与劳动者建立劳动关系，订立、履行、变更、解除或者终止劳动合同，适用本法。