无效合同中关于违约金条款，是先有约定，违反约定才会适用条款追究违约责任，现在“约定”无效了，不存在违约的情形，那么自然也就不可能适用本条款。

无效合同自始无效，违约条款在无效合同中也自始无效，只能要求造成合同无效一方承担缔约过失责任或赔偿责任。

合同无效时，有三种条款是有效的：

第一、合同中独立存在的有关解决争议方式的条款;

第二、因合同无效返还由该合同取得的财产;

第三、有过错的一方应当赔偿对方因此所受的损失，双方都有过错的应当各自承担相应责任。

法律依据：《中华人民共和国建筑法》第十二条、第十三条的规定，从事建筑活动的建筑施工企业必须具备一定的条件，并取得相应等级的资质证书，方可在其资质等级许可的范围内从事建筑活动，原告周某没有相应的施工资质，周某与被告陈某芳签订的《井巷工程施工承包合同》违反了法律、行政法规的强制性规定，该合同应当认定为无效。