土地使用权的变更的程序是先取得出让方和城市规划行政主管部门的同意，然后签订土地使用权出让合同变更协议或重新签订土地使用权出让合同实现土地使用权的变更。

根据我国《土地使用权登记管理办法》，土地使用权变更登记，是指因土地权利人发生改变，或者因土地权利人姓名或者名称、地址和土地用途等内容发生变更而进行的登记。具体变更程序如下：

1、取得出让方和城市规划行政主管部门的同意，《城市房地产管理法》第17条和《城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》第18条，都规定了土地用途的改变必须取得出让人的同意或批准。

2、签订土地使用权出让合同变更协议或重新签订土地使用权出让合同，土地使用权的变更首先需要取得出让方或着划拨方，也就是土地管理部门的同意。然后双方需要签订转让合同或着是赠与合同之类的相关文件，明确土地使用权的转让。然后按照国土部门的要求准备材料，办理相关变更登记。