1.两者在适用法律上不同：前者主要依据国务院颁布的医疗事故处理条例，后者主要适用最高人民法院关于审理人身损害赔偿。

2.鉴定机构不同：医疗事故的鉴定机构是医学会，医疗过错的鉴定机构是司法鉴定机构。

3.赔偿数额不同。

【法律依据】

《关于民事诉讼证据的若干规定》第4条中的规定是举证责任的倒置，但只是部分举证责任倒置，即涉及医方是否有医疗过错，医疗行为与损害结果之间是否存在因果关系负举证责任。