土地承包经营权证变更的程序：

1.承包方向当地乡(镇)人民政府农村经营管理部门进行申请；

2.乡(镇)人民政府农村经营管理部门受理变更申请后及时对申请材料进行审核；

3.符合规定的，报请原发证机关办理变更手续，并在农村土地承包经营权证登记簿上记载。

所需材料：

(一)变更的书面请求;

(二)已变更的农村土地承包合同或其它证明材料;

(三)农村土地承包经营权证原件。