员工入职三个月没有签合同可以申请仲裁，原则上入职一个月以上没有签订劳动合同，可以申请劳动仲裁。
【法律依据】
《劳动合同法》规定：用人单位违反本法规定不与劳动者订立无固定期限劳动合同的，自应当订立无固定期限劳动合同之日起向劳动者每月支付二倍的工资。
