商标使用许可合同费用的支付方式有：一次性支付或分期支付。付费的标准可以一次协商一个总数，也可以按照产品的产量或利润提成。
【法律依据】
《商标使用许可合同备案办法》第十条，申请商标使用许可合同备案，许可人应当按照许可使用的商标数量缴纳备案费。
