检察院不批捕后仍然提起公诉的这种行为是合法的，因为检察院不批捕绝不代表着犯罪嫌疑人就是无罪的。

【法律依据】

《刑诉法》规定，对有证据证明有犯罪事实，可能判处徒刑以上刑罚的犯罪嫌疑人、被告人，采取取保候审、监视居住等方法，尚不足以防止发生社会危险性，而有逮捕必要的，才应依法逮捕。