生育津贴被单位扣下，可以通过以下方式解决：

一、先向用人单位提出支付的要求，主动与用人单位沟通协商。

二、可向劳动争议调解委员会提出请求，要求其主持调解。

三、向劳动争议仲裁委员会提起仲裁

四、向法院起诉。

【法律依据】《女职工劳动保护特别规定》第八条规定：女职工产假期间的生育津贴，对已经参加生育保险的，按照用人单位上年度职工月平均工资的标准由生育保险基金支付；

对未参加生育保险的，按照女职工产假前工资的标准由用人单位支付。女职工依法生育产假期间，停发工资，改发生育津贴。生育保险基金支付了生育津贴的，用人单位不再支付工资。