房屋差价损失的确定方式是：

1、如果双方当事人对房屋升值的差价损失能够通过协商确定的，则按照其约定；

2、如双方当事人不能协商确定的，原则上可比照最类似房屋的市场成交价；

3、认定损失的时间点应从保护守约的买受人的利益出发，以守约方的请求为基础。

【法律依据】根据《城市房地产管理法》第三十四条，国家实行房地产价格评估制度。房地产价格评估，应当遵循公正、公平、公开的原则；

按照国家规定的技术标准和评估程序，以基准地价、标定地价和各类房屋的重置价格为基础，参照当地的市场价格进行评估。