双方是军人起诉离婚的做法是当事人所在单位领导或政治机关应当进行调解；

调解无效，并符合婚姻法规定的离婚条件的，由政治机关出具证明后，可以到婚姻登记机关申请离婚或向法院提出离婚诉讼。

根据《婚姻法》第三十三条，现役军人的配偶要求离婚，须得军人同意，但军人一方有重大过错的除外。