以物抵债协议效力被刑事判决否定，可以依据原来的债权债务关系提起民事诉讼。

【法律依据】

《物权法》第九条，不动产物权登记生效以及所有权可不登记的规定

不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但法律另有规定的除外。 依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。