工程合同付款的阶段有：
1、总承包方向分包方支付本合同总价款的30%；
2、在完成分包工程总量的50%后7天内，经双方确认后，总承包方再向分包方支付本合同总价款的30%；
3、在分包工程完成，经过双方初次验收合格后2个月内，总承包方再向分包方支付本合同总价款的30%；
4、余下10%款项做为工程质量保证金；
5、在工程保质期满后1个月内，无重大工程质量问题，总承包方则向分包方支付则向分包方支付此10%款项。
法律依据
《中华人民共和国民法典》第八百零七条 【发包人未支付工程价款的责任】发包人未按照约定支付价款的，承包人可以催告发包人在合理期限内支付价款。发包人逾期不支付的，除根据建设工程的性质不宜折价、拍卖外，承包人可以与发包人协议将该工程折价，也可以请求人民法院将该工程依法拍卖。建设工程的价款就该工程折价或者拍卖的价款优先受偿。
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