根据土地管理法的有关规定，如果要征收基本农田，一般需要由国务院获批，也就是说只要征收基本农田的必须要经过国务院的批准，只有在国务院批准之后，市或者县得人民政府才可以组织实施征收动作。
由此，只要耕地被划入基本农田保护区的，按照法律的规定必须要严格保护。
除了法律规定的国家能源、交通、水利、军事设施等重点建设项目的选址无法避开之外，其他的任何建设项目都不得占用基本农田；
如果是城市建设也必须要跳出已划定的基本农田区域，从而实现组团式、串联式的发展，并且不可以侵占基本农田建的新区，也不可以各种园区、或者建设开发区的名义实施非法圈地、或者占用基本农田。
对于农民已明确自己所承包的地属于基本农田的，且地方政府在没有获得国务院征地批文就实施的征地，属于违法行为，可向人民法院提起行政诉讼。

法律依据

《中华人民共和国土地管理法》第四十五条 为了公共利益的需要，有下列情形之一，确需征收农民集体所有的土地的，可以依法实施征收：
(一)军事和外交需要用地的;
(二)由政府组织实施的能源、交通、水利、通信、邮政等基础设施建设需要用地的;
(三)由政府组织实施的科技、教育、文化、卫生、体育、生态环境和资源保护、防灾减灾、文物保护、社区综合服务、社会福利、市政公用、优抚安置、英烈保护等公共事业需要用地的;
(四)由政府组织实施的扶贫搬迁、保障性安居工程建设需要用地的;
(五)在土地利用总体规划确定的城镇建设用地范围内，经省级以上人民政府批准由县级以上地方人民政府组织实施的成片开发建设需要用地的;
(六)法律规定为公共利益需要可以征收农民集体所有的土地的其他情形。
前款规定的建设活动，应当符合国民经济和社会发展规划、土地利用总体规划、城乡规划和专项规划;第(四)项、第(五)项规定的建设活动，还应当纳入国民经济和社会发展年度计划;第(五)项规定的成片开发并应当符合国务院自然资源主管部门规定的标准。