证明发票不是虚开的，有效证据如下：
1、商业企业销售的品种与数量与采购品种数量相对应。
2、商品的验收、入库、出库、销售等环节手续和单据等内部环节完善；
3、工业企业成本比例是否合理。
4、对于出入量大的品种进行实地盘点，会有所收获。
5、提供货物清单，物流凭证。
6、银行账、对账单要购货方的资金入账。
确定是否虚开增值税发票要看三个流是否统一，即，发票流、现金流、货物流。
通常来说，相互关联企业或者关系好的企业之间进行虚开增票的行为较多（真的买发票风险太高）。发票流和现金流造假比较容易，但是最后那个货物流很难造假，要提供货物清单、物流凭证等等一堆材料。
法律依据
《关于纳税人对外开具增值税专用发票有关问题的公告》规定 现将纳税人对外开具增值税专用发票有关问题公告如下： 纳税人通过虚增增值税进项税额偷逃税款，但对外开具增值税专用发票同时符合以下情形的，不属于对外虚开增值税专用发票： 一、纳税人向受票方纳税人销售了货物，或者提供了增值税应税劳务、应税服务； 二、纳税人向受票方纳税人收取了所销售货物、所提供应税劳务或者应税服务的款项，或者取得了索取销售款项的凭据； 三、纳税人按规定向受票方纳税人开具的增值税专用发票相关内容，与所销售货物、所提供应税劳务或者应税服务相符，且该增值税专用发票是纳税人合法取得、并以自己名义开具的。 受票方纳税人取得的符合上述情形的增值税专用发票，可以作为增值税扣税凭证抵扣进项税额。 本公告自2014年8月1日起施行。此前未处理的事项，按照本公告规定执行。
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