如果事业单位职工批捕了有可能会被停薪留职或者直接开除，具体情况还需要根据案件的实际情况进行具体分析。
《关于国家机关、事业单位工作人员受行政刑事处罚工资处理意见的复函》第六条规定，国家机关和事业单位工作人员被判处拘役的，拘役期间工资停发。期满释放，经上级主管机关批准由原单位接收并分配正式工作的，可参照被判处刑罚宣告缓刑人员缓刑期满后的工资处理办法执行。