主债务诉讼时效中断抵押权有效。《物权法》第二百零二条规定：抵押权人应当在主债权诉讼时效期间行使抵押权;未行使的，人民法院不予保护。抵押权人行使抵押权不是固定期间，而是可变期间，随着主债权诉讼时效中断而发生变化。只要在主债权诉讼时间期间内，抵押权人就仍可行使抵押权。
也就是说，过了主债权诉讼时效期间后，抵押权人丧失的是抵押权受人民法院保护的权利，即胜诉权，而抵押权本身并没有消灭，如果抵押人自愿履行担保义务的，抵押权人仍可以行使抵押权。因此，抵押权诉讼时效不受主债权诉讼时效中断的影响。