刑事自诉案件中自己申请做的司法鉴定一般情况下法院也会采纳,法律制度上没有强行规定司法鉴定必须是由律师或者法院委托进行的才可作为证据被采纳。
但是,由于不是法院指定的司法鉴定机构,很有可能被告人会对此份司法鉴定的公信力提出相关的争议。