他项权证期满法院查封房产是可以的，对房屋产权设置他项权的，并没有改变房屋的产权，房屋仍归原产权人所有，并且，有他项权证的房子也并不在人民法院所规定的不得查封、扣押、冻结的财产之列，所以法院是可以查封的。

《民事诉讼法》第二百四十四条，被执行人未按执行通知履行法律文书确定的义务，人民法院有权查封、扣押、冻结、拍卖、变卖被执行人应当履行义务部分的财产。但应当保留被执行人及其所扶养家属的生活必需品。 采取前款措施，人民法院应当作出裁定。