公司合作合同注意事项有：(一)合同伙投资撤资及职责的相关规定。(二)意见分歧解决方式。(三) 经营项目计划利益分配和责任承担。

【法律依据】

《合伙企业法》规定，合伙人在执行合伙事务中的权利主要包括以下内容：合伙人对执行合伙事务享有同等的权利。合伙企业的特点之一就是合伙经营，各合伙人无论其出资多少，都有权平等享有执行合伙企业事务的权利。