解决工程项目合同纠纷的方法如下：

1、双方协商解决纠纷；

2、协商不成的，可以申请仲裁；

3、也可以向人民法院起诉处理。

【法律依据】

《民事诉讼法》第二十三条规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。

第三十四条规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。