合伙企业转让股权所得税应当并入生产经营所得和其他所得扣除相关成本费用后的净所得，由投资者分别缴纳所得税。
【法律依据】
《合伙企业法》第六条规定，合伙企业的生产经营所得和其他所得，按照国家有关税收规定，由合伙人分别缴纳所得税。
