员工工伤解除劳动合同后二次手术费应该由工伤保险基金以及用人单位进行支付。
【法律依据】
《工伤保险条例》第三十八条,工伤职工工伤复发,确认需要治疗的,享受本条例第三十条、第三十二条和第三十三条规定的工伤待遇。