承包企业的劳动关系需要注意以下两个问题：

1、企业与员工既签订劳动合同又签订内部承包协议，发生争议后企业仅以双方系内部承包关系为由主张劳动合同无效或者不存在劳动关系，并据此认为企业不再承担用工责任的，法院不予支持；

2、内部承包约定的劳动合同解除或终止条件不符合法律规定的，不发生解除或终止劳动合同的法律效力。

【法律依据】

《劳动合同法》第十条规定，建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。